Los Grupos de Investigación del Departamento, todos ellos catalogados dentro del Plan Andaluz de Investigación (código FQM), son los siguientes:

Análisis Agroalimentario y Medioambiental (FQM 310).

- Análisis Medioambiental (FQM 141).

- Análisis Metalómico y Medioambiental (FQM 349).

- Bioquímica y Biotecnología de Organismos Fotosintéticos (CVI 214).

- Compuestos de Coordinación y Organometálicos: Aplicaciones en Procesos Catalíticos (FQM 275)