El Consejo de Gobierno es el órgano de gobierno de la Universidad y se le atribuye establecer las líneas estratégicas y programáticas de la Universidad, así como las directrices y procedimientos para su aplicación, en los ámbitos de organización de las enseñanzas, investigación, recursos humanos y económicos y elaboración de los presupuestos.

Está constituido por el Rector o Rectora, que lo preside, el Secretario o Secretaria General, el o la Gerente, y por un máximo de cincuenta miembros, quince de ellos designados por el Rector o Rectora.

Se reúne en sesión ordinaria al menos una vez cada dos meses y en sesión extraordinaria, a petición de un quinto de sus miembros no natos o a instancia del propio Rector o Rectora.